A vontade de reunir testemunhos de evoluções técnicas e didácticas foi sempre uma constante entre professores e funcionários desta instituição. Fruto disso, chegou até aos nossos dias uma preciosa colecção de instrumentos e modelos cientifico-didácticos que demonstram, de forma clara, a evolução científica e técnica no ensino experimental desde a criação da Escola Industrial, em 1852. Em 1998, devido a este desejo antigo de reunir e expor a colecção, nasce o Museu do ISEP, instalado no Instituto Superior de Engenharia do Porto.
A história da nossa colecção começa em 1852 com a publicação do decreto ministerial que cria a Escola Industrial do Porto. Durante as décadas seguintes foram criadas várias unidades museológicas como o Museu Tecnológico (1864), que compreendia, por um lado, modelos, desenhos, instrumentos, diferentes produtos e materiais e todo o tipo de objectos ilustrativos do ensino industrial e, por outro, os instrumentos relativos à indústria, modelos, desenhos e outros objectos que não fossem necessários nos restantes estabelecimentos; o Museu Industrial e Comercial do Porto (1883), com a finalidade de adquirir e expor ao público colecções de produtos e matérias-primas, acompanhados de esclarecimentos suficientes acerca da sua origem, nome de fabricante ou comerciante, preço no local da produção, despesas de transporte, mercados de consumo e todas as informações que pudessem dar a ideia do seu valor e aplicação; e a Comissão Superior de Exposições (1899) à qual competia organizar exposições agrícolas e industriais, anualmente e alternando entre Lisboa e o Porto. A dissolução deste tipo de instituições associadas ao ensino industrial não esvaneceu a ideia de conservar ou mesmo de expor, embora já não fossem apresentados produtos da indústria e do comércio, mas sim os instrumentos científicos dos laboratórios e gabinetes.